AlphaFold 2复现版开源,特斯拉CVPR现场展出皮卡|今日新闻

日期:2022-06-23 14:50:18 / 人气:257

大家好哇,本周曾经过半,最近科技圈发作了哪些大事?我们一同来看~AlphaFold 2复现版来了:略优于原版,代码已开源哥伦比亚大学零碎生物学助理教授Mohammed AlQuraishi,最近发布了AlphaFold 2的PyTorch复现版OpenFold。他表示,相较于DeepMind地下的JAX版本,这一用PyTorch的办法在训练等方面更有劣势。比方在推理1500个残基以下的序列时,速度可以更快;推理超长蛋白质链时,运用内存更少。可以在单个A100上推理超越4000个残基的序列,甚至可以应用CPU计算卸载来预测更长的序列。预测蛋白质精确度的次要度量规范是GDT(Global Distance Test,全局间隔检验),复杂地说,GDT可以近似地以为是氨基酸残基在正确地位阈值间隔内的百分比。在如下散点图中可以看到,OpenFold的均匀得分略高于AlphaFold 2。目前,复现版的代码已在GitHub上开源,论文预印版也会在近期发布。作者同时还提供了一个400K大小的数据集,包括多重比对序列信息和构造预测数据,可用于自蒸馏。开源地址:https://github.com/aqlaboratory/openfold数据集地址:https://registry.opendata.aws/openfold/Meta微软英伟达等成立元宇宙规范组织近日,全球多家科技巨头结合成立了一个名爲“元宇宙规范论坛”的组织。成员单位共有36家,包括Meta、微软、Epic、英伟达、高通、Unity等。华爲、阿里达摩院也在位列其中。除了科技、游戏大厂外,还有如万维网联盟(W3C)这样的老牌规范制定机构。

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